日本全土の内湾の波打ち際や沿岸や海岸線に生息。交代的雌雄同体で生殖は別個体が交代で雌雄の役割をする。秋と冬が旬の産地が多いが、産卵に向けて養分を蓄える春から初夏にかけては、身入りも良く、濃厚な味になる。広島で養殖されるマガキは、潮の干満により、干潮の際に空気に触れ、満潮の際にプランクトンなどを捕食することを繰り返すことで、大きく、旨みが凝縮した牡蠣に育つ。